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Nature Catalysis出新图了,快来学!Origin循环伏安CV Contour图画法!

时间:2023-11-09 来源: 浏览:

Nature Catalysis出新图了,快来学!Origin循环伏安CV Contour图画法!

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一张来自《Nature Catalysis》论文的插图,令人折服!从不同扫速测试的循环伏安CV曲线绘制CV Contour图,这也是谭编第一次遇见!能绘制此图的,真是高人!能从平凡的曲线“升华”为平面云图,这种超高的“数据图感”和逻辑思维,真不是一般人能达到的水平。然而,更令人称赞的是数据处理过程,或许该图是用matlab绘制的,今天,谭编采用Origin绘制matlab的效果,完美复刻文献图,让这种新颖的CV图广泛出现在SCI顶刊论文之中!
关注编辑之谭,这里是高端Origin科研绘图的交流园地。发布教程大部分来自读者的提问和提供的数据。自2019年1月创办起,谭编发布了420篇Origin入门与提高的教程。自2023年10月10日谭编出版《Origin科研绘图与学术图表绘制从入门到精通》起,谭编开始发布高端Origin绘图教程。
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致谢: 感谢华南师范大学华南先进光电子研究员的王老师以及王博提供本文的演示数据,本文演示Origin文件暂不分享。请广大读者采用自己的循环伏安CV数据,跟随本文教程复刻文献图。

1. 文献图解析

初看文献图,它的左Y轴有两个轴标签(阴极扫速、阳极扫速),刻度标签的变化也是分两段(0.1→0.5、0.1→0.5)。初步判断是将负扫、正扫的Contour组合而成的。但事实上并非如此,请继续往下看。
对于该文献为什么要将CV曲线“卷”成Contour,可以好好拜读这篇文献,也欢迎参考引用作者的这篇文献。谭编被他的这个绘图设计所折服,愿意为他的大作推广宣传,提升的引用率。也非常欢迎广大读者将自己的优秀绘图推荐过来,如果没有出过教程,谭编可以出教程,顺便推广您的顶刊论文。

图1. 文献图

doi: 10.1038/s41929-023-01041-z
通过单独绘制负扫、正扫Contour图,再合并组合,却得到图2B的效果。上下两张Contour图并没有平滑过渡。

图2. CV曲线及其Contour图拼接
谭编的第一直觉认为:需要将负扫、正扫的CV数据共E且顺序之后,构建在同一张共E的XYYY型工作簿中。经过一顿操作猛如虎,得到下图:

图3. 相近目标图
这些圈线是怎么连上呢?手绘?那是不科学的笨办法。
负扫取反!学过电化学的,自然对CV曲线的数据特征有一定的认识。图3中冷色区域很显然是因为负扫的电流为负值,从Contour图的颜色标尺可以看出,Contour图映射了从-6.4 mA到8.7 mA的电流强度变化。如果我们将负扫电流都乘以-1会怎样呢?

图4. 负扫取反
设置F(x)=B*-1的方式将B列负电流取反,依次操作后,可以得到目标图。以上动图演示的效果验证了这一非常关键的假设。得到下图效果。

图5. 完美目标图
完美!后续添加旋转文本标注Peak A以及反应式等简单操作,可以自行添加。如果您看到这里,能明白CV Contour图的绘图原理,并且能立即复刻此图,那说明您是Origin绘图高手。您需要持续关注、转发和收藏,以免错过高端Origin绘图公众号里谭编的经典教程。
如果还不知道怎么绘制,则请继续往下看,以下是保姆级Origin教程!感谢帮忙转发推广这种最新颖的CV Contour图的绘图技巧。

2. CV Contour图的绘制教程

2.1 CV数据简单共E处理

Contour图一般可以从两种数据类型绘制: (1)矩阵;(2)XYYY型工作表。
矩阵数据要求XY数据均匀变化,而XYYY型数据不需要均匀变化,因为XYYY型数据绘制Contour图都是自动转换为虚拟矩阵的,该转换过程存在一个拟合过程,使数据均匀化。
将负扫和正扫的CV数据拆开,分别安排为XYYY型数据表,如下图所示。
图6. 拆分CV曲线
即使我们在测试CV前设置了采样速率为1mV/point,但最终的CV数据还是会有一点点尾巴,找到工作表的最后几行,删除不平整的数据行。
图7. 删除末尾不整齐的数据
观察一下数据,G列末行的2.79549 V与A列首行的2.79853 V相近,G列首行的1.69901 V与A列末行的1.70014 V相近。我们需要将负扫的电位颠倒一下,变为跟G列正扫电位递增一致的顺序。步骤如下:
图8. 数据表的倒序
此时A与G列均为递增的电位数据,看似不吻合。我们来检查一下,将A列减去G列计算共E偏差,绘制得到下图:
图9. 共E偏差
前述简单的共E处理,得到的共E偏差仅为实际电位的1‰,实际上,让测试仪器采集得到完全相同的电位,臣妾做不到!因此,我们可以认为前述处理已基本共E,可以删除G列,构造一个共用第一列电位数据的11列CV数据,可直接绘制Contour图。

2.2 CV Contour图的绘制

前述数据处理得到下图所示的XYYY型数据表。按图中步骤绘制Contour图。
图10. Contour图的绘制
得到的Contour图中有快速模式水印,点击右边工具栏的跑人按钮,可以关闭。前面分析了负扫为负电流,需要取反。按下图步骤输入公式即可取负扫电流的相反数,而且Contour图也动态改变,逐渐趋于目标图的效果。
图11. F(x)取负电流的相反数

2.3 设置matlab风格的配色

按以下步骤选择一个matlab风格的配色(或者相近配色),注意Contour图的颜色从冷色到暖色映射一个由弱到强的数值变化,注意判断是否要勾选“翻转”复选框。
图12. Contour调色板的设置

2.4 修改颜色标尺

颜色标尺太宽,按下图步骤将“色阶宽度”减半(例如输入100),单击“应用”按钮。
图13. 色阶宽度减半
按下图步骤,修改颜色标尺刻度值保留1位小数。
图14. 标尺刻度保留1位小数
按下图步骤,设置标尺的标题文本,并设置居右显示,最后单击“确定”按钮。
图15. 标尺标题居右显示
色阶标尺的刻度太多,文献中只有2个,那么怎样减少标尺刻度值数量呢?标尺刻度数与等高线的主级别有关,请继续往下读。

2.4 设置颜色映射级别

按下图步骤,设置2个主级别使标尺刻度线变为3个,设置50个次级别使颜色渐变越平滑,设置级别“从”开始与0,是负电流忽略,突显正电流的峰值。
图16. 颜色映射级别的设置

2.5 等高线的隐藏与显示

得到的绘图中含有多条等高线,我们需要先将其隐藏,然后设置某个特殊值的等高线。按下图步骤隐藏所有等高线。
图17. 隐藏所有等高线
按下图步骤,设置1条特殊值的等高线。
图18. 设置1条等高线

3. 刻度值的设置

3.1 X刻度的设置

按下图步骤,设置X轴从1.7到2.8范围变化,且刻度整齐,保证坐标轴两端有刻度,避免残缺刻度线。
图19. X刻度的设置

3.2 文本刻度标签的设置

对于左边Y轴是非常规的刻度值,也就是刻度值不是单调递增的,而是分为阴极和阳极两段的0.1→0.5、0.1→0.5,对于非单调刻度值,通常需要通过“ 刻度索引字符串 ”自定义文本型或数值型刻度值。
按下图步骤,设置字符串刻度值。文本型刻度值可以是多个单词组成的短语,但需要用引号引起来,因为刻度值是以空格为分隔的。这种通过 刻度索引字符串 设置文本型刻度的方式,也可以用于隐藏某个刻度值,即用“ ” 引号 将空格引起来,表示该处的刻度值为空格(不显示)。
图20. 文本刻度值的设置
删除原Y轴标题,右击空白添加文本,设置内容、上下标、旋转角度等。

3.3 底色的调整

前面在选择调色板时可能没留意,所绘制的Contour图背景色为黑色,需要重新选择更好的调色板。双击图层,选择颜色映射为另一种底色为蓝紫色的plasma调色板,得到下图效果,缺失值黑色与末端颜色不一致,导致残缺,需要进一步修改。
图21. 本标签的修改结果图
按下图步骤,通过拾取刻度末端颜色来修改残缺值的颜色。
图22. 缺失值颜色的设置
最后得到完美目标图。
图23. 完美目标图
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