Nature子刊 | 2篇！浙江大学林世贤团队报道蛋白质脂化修饰的计算机辅助设计、遗传编码和生物医药应用

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蛋白质脂化调节了许多生物途径，在制药工业中起着至关重要的作用，它不是由遗传密码编码的，而是由翻译后合成的。

2023年8月10日，浙江大学林世贤团队在 Nature Chemical Biology  在线发表题为“ Computational design and genetic incorporation of lipidation mimics in living cells ”的研究论文， 该研究报告了一种设计脂化模拟的计算方法，该方法完全再现了膜结合和白蛋白结合中天然脂化的生化特性。

该研究建立了一个工程系统，用于将这些脂化模拟物整合到大肠杆菌和哺乳动物细胞中几乎任何所需的蛋白质位置。该研究展示了这些长度可调脂化模拟物在多种应用中的效用，包括改善治疗性蛋白质在活小鼠中的半衰期和活性，通过取代天然脂化将功能蛋白质锚定在膜上，功能表征携带不同长度脂化的蛋白质，以及确定给定化合物的质膜结合能力。

另外， 2023年1月2日，浙江大学林世贤团队在 Nature Structural & Molecular Biology  在线发表题为“ Genetic code expansion reveals aminoacylated lysine ubiquitination mediated by UBE2W ”的研究论文， 该研究表明遗传密码扩增揭示了由UBE2W介导的氨基化赖氨酸泛素化。 该研究使用遗传编码的非天然氨基酸作为化学探针，报告了一种以前未报道的蛋白PTM形式的鉴定和验证，氨基酰化赖氨酸泛素化，其中修饰发生在氨基酰化赖氨酸的α-胺基上。 该研究在两个人类细胞系的全部20个氨基酰化赖氨酸上鉴定出超过2000个泛素化位点。这些修饰可以介导快速的蛋白质降解，补充典型赖氨酸泛素化介导的蛋白质组降解。 此外，该研究证明了泛素偶联酶UBE2W作为氨基酰化赖氨酸泛素化的“书写者”，促进了蛋白质上的泛素化事件。 更广泛地说，氨基酰化赖氨酸泛素化的发现和验证，为利用遗传密码扩增策略鉴定和验证新的蛋白PTMs奠定了基础（ 点击阅读 ）。