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有氧条件下铁硫蛋白的一锅合成!

时间:2023-08-31 来源: 浏览:

有氧条件下铁硫蛋白的一锅合成!

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S簇是Fe-S蛋白质的一部分,存在于所有生命形式中。它们作为生物辅助因子--协助这些蛋白质进行不同生化转化的辅助分子--在呼吸和新陈代谢中发挥着重要作用。

然而,尽管成熟的 Fe-S 蛋白普遍存在,在细胞外合成它们却被证明是一项挑战。它们不仅需要复杂的细胞机制来合成,而且在与氧气接触时很容易降解,因为氧气会与它们的 Fe-S 簇发生反应。

鉴于此,近期由东京工业大学地球生命科学研究所(ELSI)副教授Kosuke Fujishima和Shawn McGlynn以及国立中央大学助理教授Po-Hsiang Wang等人组成的研究小组开发出了一种生产成熟[4Fe-4S]蛋白质的新方案,其中Fe-S簇被置于立方体结构中。

研究小组设计了一种专门的Fe-S组装蛋白系统途径,由于存在氧气清除系统,该途径可在无氧环境下运行,从而提供成熟的Fe-S蛋白。论文发表在《ACS 合成生物学》(ACS Synthetic Biology)杂志上。

图1:SUF途径的示意图

研究人员首先试图组装所谓的硫形成(SUF)系统。在细菌中,这种多蛋白系统包含产生[4Fe-4S]簇的所有必要机制。与其他具有类似功能的途径(如固氮和铁硫簇系统)相比,它对氧气的耐受性更高。研究小组创建了一种重组 SUF 途径,它由六个蛋白质亚基组成,能够在无细胞环境中发挥作用。

图2:使用 SUF 系统重建厌氧 [4Fe-4S] 簇

为了维持试管内的无氧环境,研究人员随后引入了一个三酶级联(一组按顺序发生的三个酶反应),作为氧气清除系统。这种清除系统在清除环境中的氧气的同时,还提高了系统的效率。它通过产生还原型黄素腺嘌呤二核苷酸(FADH 2 )来实现这一目的,FADH 2 是 SUF 系统合成 Fe-S 簇所需的电子载体。

最后,为了合成载脂蛋白,研究小组采用了一种专门的无细胞方法,即利用被称为 PURE 系统的重组无细胞蛋白质合成法,在体外生产蛋白质。加入遗传物质(DNA 或 mRNA)和必要的能量来源后,PURE 系统基本上就成了一个人造蛋白质工厂。

因此,研究人员将 PURE 系统、O 2 清除酶级联和 SUF 途径的组成部分结合在一个试管中,进行了一次锅式无细胞合成两种代表性[4Fe-4S]蛋白质,乌头酶和嗜热铁毒素。

图3:在有氧条件下一锅法从头合成成熟的 [4Fe-4S] 蛋白质

这项研究制定的方案对科学界具有重大意义。研究人员为合成成熟的 Fe-S 蛋白创造了一种新颖便捷的方法,不再需要笨重的手套箱。该方案克服了[4Fe-4S]簇组装和对氧气敏感的传统难题,这些难题一直是合成生物学和厌氧酶学领域的主要障碍。

通过大大扩展 PURE 系统的能力,研究人员提出的策略可以开发出新的生物技术,让人们更好地了解蛋白质合成和组装的基本原理。

着眼于未来,研究人员指出,这项工作为即将开展的研究打开了几扇大门。能够实现体外无氧环境有助于科学家复制其他类型的多蛋白途径,如固氮(NIF)和铁硫簇(ISC)途径,以合成其他含金属辅助因子的酶。这反过来又可能导致新的生物催化剂和合成细胞的开发,并有可能应用于环境修复、能源生产、医学和天体生物学。

参考文献

Po-Hsiang Wang et al, One-Pot De Novo Synthesis of [4Fe-4S] Proteins Using a Recombinant SUF System under Aerobic Conditions, ACS Synthetic Biology (2023). DOI: 10.1021/acssynbio.3c00155。

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