3 年前 Nature 发布人类蛋白互作图谱，如今我们能做什么
3 年前 Nature 发布人类蛋白互作图谱，如今我们能做什么
ShengWuXueBa
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许多疾病的发生和进展与二元蛋白质互作的异常相关，特别是在某些癌症、神经退行性等疾病中。如果可以发现更多的异常蛋白并了解其互作机制，就为发现疾病、治疗疾病提供更多线索。
2020 年 Nature 上发布了人类互作组计划成果，「 在酵母双杂交系统中，克隆了 17,500 个人类基因，通过 Y2H 一对一的互作验证，共获得了 5W+ 对 PPI ，这项工作构建了人类二元蛋白质互作组参考图谱，为人类二元蛋白质互作组提供了重要数据，是很多蛋白质互作数据库的重要数据来源。」
图片来源：文献截图
Fig. 1 | Generation of a reference interactome map using a panel of binary assays
Fig. 2 | Tissue-specific functions are largely mediated by interactions between TiP proteins and uniformly expressed proteins
但美中不足的是，该项工作中每个基因仅构建了一种转录本，而很多疾病组织（如癌症）中的蛋白质可能是来自基因的不同转录本，也可能是来自同一转录本的不同变异形式。
这些蛋白质对疾病的发展非常重要，随着质谱技术的发展，虽然通过 IP/AP-MS 等技术也已经发现了更多的人类 PPIs 数据，但遗憾的是由于很多疾病组织中的蛋白质提取纯化的难度、采用标签抗体又会丢失病理信息等因素，依然存在大量的二元蛋白质互作数据尚未被发现。
例如肿瘤细胞与正常细胞相比，在基因表达、转录和加工等方面存在明显的差异，可能导致不同的 mRNA 转录本在肿瘤细胞中表达量或比例的改变，从而导致肿瘤中蛋白质的表达水平、互作类型发生变化。
因此， 深入研究肿瘤组织中这些特异蛋白质所组成的 PPIs 作用，可以更好地理解肿瘤的发生和发展机制，并且为肿瘤治疗提供更精确的靶向策略。
为了促进人类二元蛋白互作的发现进程，建立精准的疾病组织二元蛋白互作数据库，促进靶向疗法发展，寻找这些病理组织中的特异蛋白质-蛋白质互作组十分重要。
欧易生物基于近 20 年的酵母杂交技术服务背景优势，特此发起肿瘤二元互作组 计划 。
以肿瘤相关组织为起始，在特定组织水平上，构建特定转录本的 cDNA 酵母表达文库，利用酵母双杂交筛选技术，发现肿瘤组织中不同转录本间的蛋白质二元互作数据，揭示肿瘤环境中的蛋白质互作全景图。助力深入理解蛋白质功能和细胞生物学过程，并为开发新的治疗方法提供理论基础。
具体活动内容及参与方式详见海报↓
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酵母双杂交技术介绍：
酵母双杂交是利用酵母表达系统，在活细胞内检测蛋白质互作的技术。其原理是基于蛋白质相互作用会导致酵母中转录因子的激活，从而促进报告基因的表达。
优势介绍：
1. 高通量筛选：酵母双杂交是一种高通量筛选方法，可以通过构建特定组织的 cDNA 文库和文库筛选方式，同时分析多个蛋白质相互作用。
2. 不需要抗体：在活细胞内，利用酵母表达系统，在核酸操作水平上，直接通过酵母生长状态，检测蛋白质是否互作。
不受环境影响：免疫共沉淀的效果受到生理环境、蛋白纯化环境等因素的影响。而酵母双杂交则不受这些因素的影响，因为该实验方法是在活细胞内检测蛋白质互作的，互作水平更接近真实的生理水平。
酵母双杂交与免疫共沉淀技术比较
注：建议结合多种技术进行研究，有助于获得更全面、准确、可靠的互作数据。
欧易生物已构建完成的肿瘤文库
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内容审核：潘成 项目审核：周育红
题图来源：图虫创意