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不会编程也能做扩增子生信分析的奥秘—微科盟生科云云流程

时间:2022-06-22 来源: 浏览:

不会编程也能做扩增子生信分析的奥秘—微科盟生科云云流程

微科盟 微生态
微生态

Microeco2016

专注各种微生态的研究,主要采用的技术有菌群多样性测序,宏基因组测序,宏转录组测序,基因组测序,转录组测序,蛋白质组和代谢组相关技术。微生态会定期通过网络举行各种微生态研究技术的公益讲座,汇总微生态相关研究进展,解读微生态研究论文。

收录于合集

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生科云网址: https://www.bioincloud.tech


扩增子测序是一种高靶向性方法,用于分析特定基因组区域中的基因变异 ,主要包括16S rDNA测序、18S rDNA测序、ITS测序及目标区域扩增子测序等。采用第二代高通量测序平台测定的16S/18S /ITS某个高变区域的序列,来反映环境样品在细菌、真菌、古菌分类方面物种之间的差异,对研究海洋、土壤、肠道粪便等环境中的微生物构成有重要的指导作用,同时也是系统发育和分类学研究中一种广泛使用的方法
在传统的扩增子数据分析结果中,我们拿到的是已经设置好参数,选定了分组,直接做好的图片和表格结果,老师们主要从分析好的结果中去总结自己的实验情况。 如果需要进一步挖掘数据,还需要自己掌握大量的生信分析知识,甚至是数据编程等机器语言 ,所以传统的组学数据分析中,要么数据结果分析的比较浅,只是在既定结果上的总结;要么需要花费大量的学习时间成本,较为繁琐。
为了让科研人更好地挖掘和处理数据, 0代码 就能解决多个组学的数据分析问题 。深圳微科盟集团开发了 生科云云流程 ,您只需要联系微科盟组学老师,完成数据评估后,就可以将原始数据上传至生科云云流程上,无需繁复费时的分析代码, 点击几下鼠标 就可以生成CNS级别的高清矢量图。
云流程针对扩增子,提供一套分析方案,该方案包含了一系列分析工具, 解决了用户挑选工具的难题 ;同时,云流程将用户的原始测序数据存储在云端,提前帮用户做好各个分析工具输入数据的预处理工作, 用户在使用分析工具时, 不需要自己上传分析数据 ,解决了用户数据预处理的难题;云流程采用微科盟自主研发的流程化架构, 能够上线相互之间存在依赖关系的工具,这使得用户能够 控制流程中存在依赖关系的关键步骤 , 如质量控制、序列比对、生成丰度表等操作原始数据的步骤。
云流程体验地址 https://www.bioincloud.tech/ ,或点击文末“阅读原文”处。详情可咨询微科盟组学老师。
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生科云云流程0代码开展微生物扩增子生信分析视频讲解
部分云流程内容如下:

1、云流程界面: 免费示例 流程体验/即时生成网页版报告

2、分组方案在线修改添加, 不限次数的再分析

3 一键化 完成新方案的所有流程分析,时间短操作简便,无需单个分析模块逐个分析

4、 分析模块逻辑清晰,各个参数设置 多元且简单

5、自带 SVG图片编辑器 ,可以随时修改调整结果图且可用于外部数据

微科盟生科云优势:

1、多元化的分析模式 :云流程分析、一键化分析、云工具分析;

多个组学的云流程分析

免费实用数据分析工具(32个云工具+ 3个一键化分析流程)

2、在线化的图片编辑 :SVG编辑器支持在线作图修改,可导出多种格式图片;

3、可信赖的服务周期 :承诺数据云端存储两年,无限次售后问题解决;

4、缩短化的分析周期 :项目周期缩短,数据整体分析可在1-2天内完成;

5、便携式的沟通模式 :独立的微信项目群沟通数据分析问题,在线实时交流;

6、简洁化的分析操作 :生科云全程操作简单,便于上手使用,邮件提醒;

7、时效性的不断完善 :长期进行生科云的模块升级与软件的时效更新。

微科盟生科云与其他平台相比:

微科盟组学老师联系方式

联系您所添加的 任一 微科盟组学老师 ,如您未添加过微科盟组学老师,请 联系组学老师13。

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