Science背靠背 | 程亦凡及张敏等人同时揭示INO80更倾向于六聚体而不是核小体的潜在机理
Science背靠背 | 程亦凡及张敏等人同时揭示INO80更倾向于六聚体而不是核小体的潜在机理
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iNature
H2A-H2B组蛋白二聚体的丢失是活跃转录基因的标志,但是在非经典核小体粒子的背景下,细胞机制的功能仍然不为人所知。 而与其他染色质重塑因子不同,INO80更倾向于重塑六聚体,但为什么INO80更倾向于六聚体而不是核小体仍然不清楚。
2023年6月29日,欧洲分子生物学实验室Sebastian Eustermann团队(张敏为第一作者)在 Science 在线发表题为“ Hexasome-INO80 complex reveals structural basis of noncanonical nucleosome remodeling ”的研究论文,该研究展示了 INO80如何识别H2A-H2B缺失后出现的六聚体核小体的非规范DNA和组蛋白特征。 一个大的结构重排将INO80的催化核心转换成一个独特的、自旋的重塑模式,而它的核肌动蛋白模块仍然被拴在一长段未包裹的连接体DNA上。直接感知暴露的H3-H4组蛋白界面激活INO80,独立于H2A-H2B酸性斑块。 该研究结果揭示了H2A-H2B的缺失如何使重塑者进入一个不同的、尚未被探索的能量驱动的染色质调控层。
另外, 2023年6月28日, 加州大学旧金山分校程亦凡,Geeta J. Narlikar及Muryam A. Gourdet共同通讯在 Science 在线发表题为“ Reorientation of INO80 on hexasomes reveals basis for mechanistic versatility”和“Hexasome-INO80 complex reveals structural basis of noncanonical nucleosome remodeling ”的研究论文,该研究报道了酿酒酵母INO80与六聚体 核小体 或核小体结合的结构。INO80以完全不同的方向结合这两种底物。在 六聚体核小体 上,INO80将其ATP酶亚基INO80置于超螺旋位置(SHL)-2,与先前在核小体上看到的SHL-6/-7相反。该研究结果表明,INO80对 六聚体核小体 的作用类似于其他重塑蛋白对核小体的作用,因此INO80在SHL-2附近最活跃。SHL-2位点也在INO80对核小体的重塑中起关键作用。 总的来说,INO80对优先 六聚体核小体 滑动的机制适应表明,亚核小体颗粒起着相当大的调节作用。
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