2023年
6月28日
，
博德研究所张锋团队
在
Nature
在线发表题为
“
Fanzor is a eukaryotic programmable RNA-guided endonuclease
”
的
突破性研究
，
该团队在动物中发现能对人类基因组进行编辑、类似于CRISPR的基因编辑系统。其中的
Fanzor蛋白是首次在真核生物中发现受RNA引导的DNA切割酶！
根据麻省理工学院（MIT）新闻稿，
通过进一步的优化，Fanzor有望成为较现有CRISPR/Cas系统更为精确、更易被递送至人类细胞的基因编辑工具！
另外，
2023年
4月6日
，
博德研究所张锋团队
在
Science
在线发表题为
“
Structure of the R2 non-LTR retrotransposon initiating target-primed reverse transcription
”
的研究论文，该研究报道了
Bombyx mori R2
non-LTR
逆转录转座子在其核糖体DNA靶点处启动TPRT的冷冻电子显微镜结构。
目标DNA序列在插入位点被解开，并被上游基序识别。逆转录酶(RT)结构域的延伸识别逆转录转座子RNA，并引导3 ’端进入RT活性位点以模板逆转录。
该研究使用Cas9在体外将R2重定向到非原生序列，这表明未来可以作为一种基于可重编程RNA的基因插入工具。
2023年
3月29日
，
博德研究所张锋团队
在
Nature
在线发表题为
“
Programmable protein delivery with a bacterial contractile injection system
”
的研究论文，该研究发现Photorhabdus毒力盒(PVC)——来自昆虫病原细菌Photorhabdus asymbiotica的eCIS——的目标选择是由PVC尾纤维的远端结合元件对目标受体的特异性识别介导的。在尾巴纤维的结构引导工程中，该研究表明
PVC
可以被重新编程，以靶向这些系统不天然靶向的生物(包括人类细胞和小鼠)，效率接近100%。最后，该研究发现
PVC
可以装载不同的蛋白质载荷，包括Cas9、碱基编辑器和毒素，并可以将它们功能性地输送到人类细胞中。总之，该研究结果表明
PVC
是一种可编程的蛋白质传递装置，可能应用于基因治疗、癌症治疗和生物控制。
2023年
1月5日
，
博德研究所/哈佛医学院/麻省理工学院
张锋团队
在
Cell
在线发表题为
“
A transcription factor atlas of directed differentiation
”
的研究论文，为了全面了解TF及其控制的程序，该研究
创建了一个包含所有注释的人类TF剪接异构体的条形码库(> 3500)，并将其应用于构建TF图谱，以单细胞分辨率绘制过表达每个TF的人类胚胎干细胞(hESCs)的表达谱。
该研究将TF诱导的表达谱映射到参考细胞类型，并验证候选TF用于生成不同的细胞类型，涵盖所有三个胚层和滋养层。具有库子集的靶向筛选使研究人员能够创建定制的细胞疾病模型，并整合mRNA表达和染色质可及性数据，以识别下游调控因子。最后，
该研究通过开发和验证一种预测TF组合的策略来描述组合TF过表达的影响，该策略产生匹配参考细胞类型的目标表达谱，以加速细胞工程工作。
2013年有报道称，Fanzor (Fz)是一种由转座因子(TE)编码的真核TnpB-IS200/ IS605样蛋白，最初认为Fzs(和原核TnpBs)可能通过甲基转移酶活性调节TE活性。
最近，TnpB被报道为一类新的RNA引导系统的一部分，称为OMEGA(专性移动元素引导活性，Obligate Mobile Element-guided Activity)。
OMEGA系统包含一个RNA引导的内切酶蛋白(即TnpB, IscB, IsrB)和一个从转座子端区转录的非编码RNA (ncRNA)(称为ωRNA)。
OMEGA系统是CRISPR-Cas系统的祖先，TnpB进化成单RNA引导的内切酶Cas12。TnpB与Fz具有远程同源性。
这些发现提高了Fz可能是真核型CRISPR-Cas/OMEGA系统的可能性。
通过结合系统基因组学、生化和结构研究，该研究试图确定Fz的酶活性和机制，并对其进行重编程，用于人类基因组编辑。
该研究报告了Fz的生化特性，表明它是一种RNA引导的DNA内切酶。该研究还表明Fz可以被重新编程用于人类基因组工程应用。
该研究利用冷冻电镜分析了Spizellomyces punctatus Fz (SpuFz)在2.7Å的结构，揭示了Fz、TnpB和Cas12之间的核心区域的保守性，尽管同源RNA结构不同。
总之，该研究结果表明Fz是真核生物的OMEGA系统，表明RNA引导的内切酶存在于生命的所有三个领域。
参考消息：
https://www.nature.com/articles/s41586-023-06356-2
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