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OriginPro:ROC曲线【数据绘图】

时间:2021-12-02 来源: 浏览:

OriginPro:ROC曲线【数据绘图】

原创 Changyu Wu 数据绘图
数据绘图

ScientificPlots

专注于数据绘图和分析。Originlab,Excel,……

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ROC曲线 的全称是受试者工作特征(Receiver Operating Characteristic)曲线,是非常重要和常见的统计分析方法。

如果已经计算好 FPRTPR ,可以直接使用最简单的 Line 图绘制。本教程使用的是原始数据,需统计计算后给出对应的参数,并绘制 ROC曲线

数据格式

  • 示例数据为使用两种方法测量得到的RMSF患者和正常人的钠水平,数据格式为 XYY 形式,其中第1列为人群信息,第2列为Method1测量的结果,第3列为Method1测量的结果。

绘制图形

  • 选中后两列数据,使用 Statistics 菜单中的 ROC Curve 来绘制图形。

  • 在弹出的对话框里设定参数。

    • Positive State Value :设定哪个 State 是正类,此处选择 RMSF

    • Threshold Method :设定求解 cutoffs 的方法,可以使用默认选项。

    • Test Direction :选择检测的数据方向, Positive v.s. High 指大的测量值表示正类, Positive v.s. Low 指的小的测量值表示正类。此例中选择 Positive v.s. Low ,即钠水平较小时为正类。

    • ROC Curve :勾选时会输出 ROC曲线

    • Standard Error and Confidence Interval :勾选后输出 曲线下面积AUC )的SE和可信区间。

    • With Diagonal Reference Line

      勾选后显示参考线,即(0,0)-(1,1)的连线。

    • Optimal Cutpoint

      勾选后显示最佳截断点。

    • Recalculate :选中重计算方式,默认的是 Manual ,即手动更新。

    • Input Data :在 Data 里选定两种方法的测量结果,即第2和3列;在 State 里选择第1列数据。

    • Computational Control :在此处设定相关的计算参数。

    • Output :输出数据的选项,可以使用默认值。

  • 点击 OK 后得到结果,包括统计分析数据和图,其中 Area Under the Curve 表示的就是曲线下面积。

格式设定

  • 双击分析报告里的 ROC图 ,在单独窗口中打开图形。

  • 可以对最后的 ROC图 进行格式设定,包括曲线粗细、颜色、图例等。【在微信公众号 数据绘图 ( ScientificPlots )后台回复 格式 ,查看详细教程】

完成图形

所用软件:OriginLab OriginPro 2022@Windows 11 pro 。

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Changyu Wu

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