Nature Methods | 吴海臣/刘蕾首次实现基于纳米孔技术的短肽序列测定

iNature

目前仍需要提高灵敏度和通量的直接蛋白测序技术。

2023年11月13日，中国科学院化学研究所吴海臣及中国科学院高能物理研究所刘蕾共同通讯（张云和尹雅琨为共同第一作者）在 Nature Methods （IF=48）在线发表题为“ Peptide sequencing based on host-guest interaction-assisted nanopore sensing ”的研究论文， 该研究提出了一种基于酶裂解和主-客体相互作用辅助纳米孔传感的肽测序替代方法。

偶然发现，在含有苯丙氨酸的肽的特定位置上，任何蛋白原氨基酸的身份都可以通过在 胍环 [7]脲存在的情况下通过α-溶血素纳米孔转运时的电流阻塞来确定。在此基础上，进一步提出了肽测序的概念验证演示，通过羧基肽酶从肽的C端依次切割氨基酸，然后用纳米孔中的肽探针确定它们的身份和序列。 随着未来的优化，该研究指出了一种基于纳米孔的蛋白质测序的不同方法。