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老司机带你轻松搞定基因来源物种分层柱形图

时间:2022-05-13 来源: 浏览:

老司机带你轻松搞定基因来源物种分层柱形图

微科盟 微生态
微生态

Microeco2016

专注各种微生态的研究,主要采用的技术有菌群多样性测序,宏基因组测序,宏转录组测序,基因组测序,转录组测序,蛋白质组和代谢组相关技术。微生态会定期通过网络举行各种微生态研究技术的公益讲座,汇总微生态相关研究进展,解读微生态研究论文。

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 微科盟生科云 (https://www.bioincloud.tech)  旨在帮助客户 简化 分析流程, 助力 科研的基础上,不仅开发了 全自动化一键式 批量 宏基因组 数据分析流程,还开发了 单个 分析 小程序 ,可大大方便客户 灵活 分析。
  基因来源物种分层柱形图 一般是经过 LEfSe 进行 分组间显著性差异分析 之后,将各个分组的 特征功能 挑出来,根据HUMAnN2的分析结果,得到功能的物种来源,绘制 功能物种来源 组成柱形图。分析流程只需准备好 单基因物种来源表格 ,便可完成 基因来源物种分层柱形图 的制作,更高效的 挖掘基因对应物种来源信息

结果展示

   

接下来我们一起来看看我们的 视频 讲解吧!

 

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微科盟生科云平台——基因物种来源分层柱形图实操讲解

 

操作方法也可以看我们下面的 说明 哦~

一、导入单基因物种来源表格

    制表符分隔的文本文件表格;数据表必须含 首行首格 ,行名为 基因名物种名 ,用 “ | ” 隔开,唯一不可重复,但只能有一个基因,如果输入的是 多基因物种来源表 ,作图默认选择表中 第一个基因 ;列名为 样本名 ,唯一不可重复;表中第二行为样本所属分组,示例表格如下:

二、选定分组对应的颜色

   可选择 默认值 ,也可以按照 个人需要 进行调整 颜色明亮 程度,示例如下:

   分组对应颜色:

三、提交任务

  点击 提交任务 ,可选择任务完成时发邮件提醒,可避免等待运行时间,运行结束后可预览结果图,并下载结果文件。

  更多小工具和一键化程序上线  

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