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黄素( Flavin )辅酶是生物氧化还原反应中得到广泛使用, DNA 光解酶( DNA photolyases )通过与黄素发色团 FAD ( flavin chromophore )配合实现使用蓝光修复 DNA 并进行光还原反应。光还原反应包括两个单电子转移步骤向 FAD 转移,其中包括间歇质子化过程激活修复 DNA 酶的活性。
有鉴于此, 马尔堡大学 Lars-Oliver Essen 、台湾研究院生物化学研究所蔡明道( Ming-Daw Tsai )、 Yoshitaka Bessho 等 报道通过时间分辨率达到飞秒的 X 射线晶体学描述光激发电子转移后, FAD 和 Asn/Arg-Asp 氧化还原三位一体结构之间在 ns 至 ms 时间尺度内相互作用,发现光解酶和隐花素之间的相互作用调控 FAD 重新杂化和质子化。
本文要点
要点1. 在第一个电子转移后, FAD ·- 的异咯嗪环发生强烈的扭曲,因此精氨酸接近并且稳定负电荷状态的 FAD ·- 。随后精氨酸 - 天冬氨酸盐桥断裂,实现质子从精氨酸转移到 FAD ·- ,生成 FADH· 。
要点2. 本文通过分子影像过程,展示了氧化还原辅酶的蛋白质环境如何控制和进行多个电子 / 质子的有序转移,说明了 FAD ·- 的质子化过程机理 , 发现了 FAD 氧化还原传感器三位一体结构 Asn/Arg-Asp ,分别稳定黄素的不同氧化还原状态,对类醌蛋白的结构机理提供了更加深入的理解。
这种现象可能应用于其他氧化还原反应体系,比如光合成过程。
Maestre-Reyna, M., Yang, CH., Nango, E. et al. Serial crystallography captures dynamic control of sequential electron and proton transfer events in a flavoenzyme. Nat. Chem. (2022)
DOI: 10.1038/s41557-022-00922-3
https://www.nature.com/articles/s41557-022-00922-3
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